feat: 实现环境变量预设功能 & 移除稀疏检出

## 后端改动
- 添加 Project.envPresets 字段（JSON 格式）
- 移除 Deployment.env 字段，统一使用 envVars
- 更新部署 DTO，支持 envVars (Record<string, string>)
- pipeline-runner 支持解析并注入 envVars 到环境
- 移除稀疏检出模板和相关环境变量
- 优化代码格式（Biome lint & format）

## 前端改动
- 新增 EnvPresetsEditor 组件（支持单选/多选/输入框类型）
- 项目创建/编辑界面集成环境预设编辑器
- 部署界面基于预设动态生成环境变量表单
- 移除稀疏检出表单项
- 项目详情页添加环境变量预设配置 tab
- 优化部署界面布局（基本参数 & 环境变量分区）

## 文档
- 添加完整文档目录结构（docs/）
- 创建设计文档 design-0005（部署流程重构）
- 添加 API 文档、架构设计文档等

## 数据库
- 执行 prisma db push 同步 schema 变更

apps/server/app.ts

@@ -1,8 +1,8 @@
 import Koa from 'koa';
-import { initMiddlewares } from './middlewares/index.ts';
-import { log } from './libs/logger.ts';
 import { ExecutionQueue } from './libs/execution-queue.ts';
+import { log } from './libs/logger.ts';
 import { initializePipelineTemplates } from './libs/pipeline-template.ts';
+import { initMiddlewares } from './middlewares/index.ts';
 
 // 初始化应用
 async function initializeApp() {
@@ -26,7 +26,7 @@ async function initializeApp() {
 }
 
 // 启动应用
-initializeApp().catch(error => {
+initializeApp().catch((error) => {
   console.error('Failed to start application:', error);
   process.exit(1);
 });